歐標生物柴油設備標準中要考慮很多指標，有些指標是與石油柴油共有的，包括密度、運動粘度、閃點、硫含量、10％蒸余物殘碳、十六烷值、灰分、水含量、機械雜質、銅片腐蝕、燃料安定性、低溫性等；還有一些指標是生物柴油所特有的，包括總酯含量、游離甘油含量、甘油單酯、二酯及三酯含量、甲醇含量、碘價及多元不飽和脂肪酸甲酯的含量、酸值、磷含量、堿及堿土金屬含量等；另外，還有一些額外的指標包括餾程、燃燒熱值、潤滑性、不皂化物含量等，是可以選擇的。